La electromiografía se puede realizar en prácticamente en cualquier músculo esquelético del cuerpo. En ocasiones se solicita en músculos específicos como por ejemplo en músculos faciales para evaluar el estado de los músculos en parálisis facial y ver pronóstico de recuperación, en lengua en casos muy específicos como enfermedades neurodegenerativas que causan debilidad en músculos de lengua, laringe o faringe, así como en esfínter anal en casos especiales como incontinencia, para ver el estado funcional del músculo.